Program Studi Doktor/S3 antara lain:

1. Administrasi Publik
2. Ilmu Ekonomi
3. Ilmu Hukum
4. Ilmu Kedokteran
5. Ilmu Lingkungan
6. Ilmu Peternakan
7. Ilmu Sosial
   
8. Manajemen Sumber Daya Pantai
9. Teknik Arsitektur dan Perkotaan
10. Teknik Sipil

Program Studi Magister/S2 antara lain:

1. Agribisnis
2. Akuntansi
3. Biologi
4. Epidemiologi
5. Fisika
6. Ilmu Administrasi
7. Ilmu Biomedik
   
8. Ilmu Ekonomi dan Studi Pembangunan
9. Ilmu Gizi
10. Ilmu Hukum
11. Ilmu Kelautan
12. Ilmu Kesehatan Masyarakat
13. Ilmu Komunikasi
14. Ilmu Lingkungan
15. Ilmu Linguistik
16. Ilmu Politik
17. Ilmu Susastra
18. Ilmu Ternak
19. Kenotariatan
20. Keperawatan
21. Kesehatan Lingkungan
22. Manajemen
23. Manajemen Sumber Daya Pantai
24. Promosi Kesehatan
25. Sejarah
26. Sistem Informasi
27. Teknik Arsitektur
28. Teknik Kimia
29. Teknik Mesin
30. Teknik Pembangunan Wilayah dan Kota
31. Teknik Sipil